以往因为有中央星域强大的军事力量威慑，所有分裂势力只能夹着尾巴做人。现在中央星域自顾不暇，又有附庸族的反判拖累，不趁这个机会独立，就再也找不到这么好的机会了。

于是边境上的星域纷纷独立，不过所有人都明白中央星域的混乱只是暂时的，一旦中央星域稳定下来，隶属于中央星域的几大舰队完全有能力剿灭任何一个宣布独立的星域，所以宣布独立的星域很快就组成的攻守同盟，共同抵抗来自于中央星域的军事打击。

总而言之，亚特兰蒂斯内部绝不像表面上看起来那么协调一致，而是充满了恩怨情仇，中不过以往在中央星域强大武力的压迫之下，所有的矛盾都只能藏于暗处，现在机会来了，正是有仇报仇有冤报冤的时候。

混乱的最终结果，是亚特兰蒂斯星国中央星域一百多光年的范围的民众，在几十年的时间里不断地离开移民星，三十几年之后，这些移民星上再也没有民众停留。

其实各个行星上还有许多不愿意离开的民众，对于这些固执的家伙，就只能让他们听天由命了。

民众的撤离还在进行的时候，中央星域的一支舰队却来到了附庸族叛乱的行星，展开了灭绝人性的强力手段，对叛变的附庸族进行了惨无人道的屠杀。

接连屠掉了四个叛乱的附庸族之后，所有心怀不轨的附庸族全部偃旗息鼓，凡是拥有飞船的附庸族全部极力逃出亚特兰蒂斯星国，没有这份儿能力的，就只好缩着脖子在亚人的屠刀下瑟瑟发抖。

只不过附庸族好对付，重新独立的边远星域就没那么容易收拾了，边远星域结成了三个攻守同盟，距离碟族星域比较近的星域甚至开始和碟族讲和。

形势对中央星域极端不利，在这个节骨眼儿上，中央星域的高层居然集体出走，带着舰队离开了不久前刚刚确立的新首都星，远赴七族联盟，希望商族和另一个科技种族能给予军事方面的援助，重新统一亚特兰蒂斯星国。

七族联盟里只有三个科技种族，如果亚特兰蒂斯分裂，那么原本强大的国家就变成了一盘散沙，七族联盟军的科技派十分不利，只有一个统一的、强大的亚特兰蒂斯，才能给予科技派强有力的支持。

亚人高层抱着这样的信念离开了亚特兰蒂斯，跟随高层离开的还有一支护航舰队，全舰队的官兵都是最狂热最忠诚的光神教教徒。

高层的突然离去，令原属于中央星域的亚人舰队无所适从，各地的实权派干脆也加入了独立星域的攻守同盟，好好的星国顿时分裂成数十个小国家。

这些小国家又组成了三个不同的攻守同盟，彼此之间即防备又合作。

结果高层没借来舰队，反而失去了原本的根基，不得不组建流亡政府，将希望全部寄托于七族联盟之上最后搏一把。